本會自成立以來，共舉辦33次，合計40場次的研討會，茲將各研討會時間、主題、討論議題與參加對象，彙集如下，以供參考。
101年度
101.08全民健康保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第二十次聯席座談會：專題報告包括：「健保新制財務推估（含補充保險費金額試算）」；專題介紹包括：「護理近、中、長程改革計畫」、「重振五大科守護偏鄉醫療十二大策略簡介」。(會議資料、會議紀錄)。
101.03全民健康保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第十九次聯席座談會：專題報告包括：「二代健保籌備情形」、「100年全民健康保險費率精算及財務報告」簡介；討論議題包括：「精算報告之推估費率與二代健保費率」、「由財務現況探討二代健保施行時點」、「二代健保財務之其他影響因素」。（會議資料、會議紀錄）
100年度
100.06 全民健康保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第十八次聯席座談會：討論議題包括：「我國健保醫療費用較高項目之分析探討-以透析、呼吸器、葉克膜利用為例」、「國際對醫療資源不當耗用之評估原則與改善策略」。
100.10全民健康保險法施行細則修正草案座談會：衛生署為配合二代健保修法檢討施行細則修正所涉重要政策議題交議本會討論，為提供周延修法意見，本會先召開座談會。討論議題包括：「在臺居留滿6個月之定義」、「取消退休人員得以第6類身分加保之規定」、「停復保制度之存廢」、「專技人員投保金額下限調降等規定」、「投保單位計繳補充保險費規定」、「醫療資源缺乏地區部分負擔減免比率」等六項政策議題及其他重要修正條文。
99年度
99.12 全民健康保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第十七次聯席座談會：討論議題包括：「重大傷病醫療利用分析」。
98年度
98.07 全民健康保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第十四次聯席座談會：討論議題包括：「日本、韓國長期照護保險的經驗」、「德國、荷蘭長期照護保險的經驗」及「我國長期照護保險現況檢討及規劃方向」等。
98.12 全民健康保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第十五次聯席座談會：討論議題包括：「全民健保99年度總額協商結果」、「全民健保99年度各部門總額協定事項之落實」及「全民健康保險開源節流改進措施暨財務收支平衡」等。
97年度
97.02 監理體制及運作研討會：討論議題包括：「全民健保之權責範疇」、「亞太區健保制度比較」、「如何提升委員會運作」及「研議有效提升本會組織之運作功能案」等。
97.04 全民健康保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第十一次聯席座談會：討論議題包括：「各國推動DRGs經驗對我國之啟發」、「TW-DRGs之規劃方案」、「醫界對TW-DRGs之觀點」及「民眾對TW-DRGs之觀點」等。
96年度
96.02 全民健康保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第七次聯席座談會： 討論議題包括「醫事服務機構限制特約之法律觀點」及「全民健康保險監理會未來運作機制規劃」等。
96.06 全民健康保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第九次聯席座談會： 討論議題包括「全民健康保險費率精算介紹」及「全民健保財務籌集與醫療使用公平性之探討」等。
95年度
95.01 全民健康保險醫療服務量問題與對策研討會： 邀請學者專家針對現制，以需求面、供給面及政策面向，進行評估及檢討。
95.03 全民健康保險監理委員會暨全民健康保險費用協定委員會第三次聯席座談會： 討論議題包括「全民健保醫療給付費用總額範圍」之擬定程序及方向及「全民健康保險法修正草案」中二會合一之組織改革部分，委員組成等各項建議案等。
95.08 全民健保保險監理委員會暨全民健康保險醫療費用協定委員會第五次聯席座談會：討論議題包括「近期健保醫療支出面改善策略及預期成效」及「近期健保收入面改善策略及預期成效」等。
94年度
94.10 全民健康保險監理委員會暨全民健康保險費用協定委員會第一次聯席座談會： 討論議題包括全民健保委員會之組成與運作及如何落實健保財務收支連動權責機制等。
94.12 全民健康保險醫療服務量問題與對策研討會專家學者座談會： 邀請學者專家針對現制，以需求面、供給面及政策面向，進行評估及檢討座談。
93年度
93.11 德國健康保險制度座談會：討論議題包括德國社會保險制度整體概述、疾病基金會聯邦聯合會與保險特約醫師公會全國聯合會與醫院協會等機構之組織、角色、功能與改革、醫療費用總額分配概況、德國健保制度對台灣之啟示等。
93.11 家庭醫師整合性照護制度研討會：討論議題包括基層醫療國際發展趨勢與國際比較、本土化家醫制度的推動情形、健保家醫試辦計畫執行成效等。
93.12 二代健保規劃成果研討會：討論議題包括財源籌措、資源配置與支付制度、品質提升與資源提供、社會參與與保險治理等。
91年度
91.06 全民健保總額支付制度研討會：討論議題包括總額支付制度之政策規劃、推動與實施現況。
91.12 91年度全民健康保險專題研討會： 討論議題包括健保雙漲案、藥價差問題、總額支付制度推動情形及二代健保規劃方向等。
90年度
90.10 全民健保醫療利用適當性研討會：討論議題包括健保醫療給付及醫療利用之國際發展趨勢、健保醫療利用與費用結構/費用控制、總額支付制對醫療利用的影響、健保資訊系統在醫療利用管理之應用等相關議題。
89年度
89.01 全民健保藥費支付策略研討會：討論議題包括藥價差、藥費支付策略運作議題等。
89.01-03 職業工會健保財務管理研討會（四場次）：討論議題包括第二類投保單位健保財務管理與問題、勞政相關法規及優良職業工會財務管理經驗分享等。
89.08 全民健保牙醫門診總額支付制度研討會：討論議題包括牙醫門診總額支付制度實施規劃、回顧與展望
89.09 全民健保法修法研討會（三場次）：討論議題包括全民健保法之修正草案重點。
89.11 全民健保部分負擔座談會：討論議題包括門診部分負擔實施情形與調整方案。
88年度
88.03 全民健保重要議題研討會-第一階段：討論議題包括全民健保公平性、財務收支平衡、安全準備來源與監督問題及落實財務責任制度等。
88.04 全民健保重要議題研討會-第二階段：討論議題包括全民健保公平性及財務收支平衡再討論、從財務平衡強化醫學中心醫療角色與功能及整合監理會、費協會組織功能。
88.09 全民健保藥價費用節制研討會：討論議題包括健保局對藥品費用與藥價政策之檢討、健保費用節制的總體面與個體面思考、藥價差與藥品行銷市場行為等。
87年度
87.01-02 全民健保保險人多元化研討會：討論議題包括保險人應有之資格與條件、如何建立保險人運作模式以達多元化目的、保險人多元化後監督體系之運作等。
86年度
86.01 全民健保修法研討會：討論議題包括健保法中具有爭議部分，研議修正並逐條討論。
86.11-87.05 全民健保專題研討會（三場）：討論議題包括HMO制度之探討、長期照護與健康保險、山地離島地區醫療照護等。
85年度
85.04 全民健保重要議題研討會：討論議題包括全民健保承保、財務、保險人組織屬性、醫療服務體系及醫療費用支付及審查等。
