衛生福利部為強化澎湖地區急重症在地醫療，自102年起補助4億餘元辦理相關措施，使澎湖地區醫院之空中緊急醫療轉診率已下降25%，並於心血管照護中心成立後1年半內進行227例心導管手術，105年度將特別針對婦產科及兒科、外傷、腦中風及心血管照護之醫師人力支援，保障澎湖地區婦兒科及急重症醫療照護，更加提升澎湖醫療品質。
為強化澎湖地區的在地化醫療服務，該部近三年針對澎湖地區之三軍總醫院澎湖分院及衛生福利部澎湖醫院，共計補助4億餘元，包括補助建置急診照護中心、心血管照護中心、化療中心、醫院營運維持費、空中緊急醫療後送費用、自行搭機來台就醫交通費用、提升婦產科及兒科醫療品質及資源整合計畫、全民健康保險山地離島地區醫療給付效益提昇計畫、緊急醫療資源不足地區急救責任醫院急診診察費加乘、全民健康保險醫療資源不足地區之醫療服務提升計畫保障一點一元等計畫，其中人力補助公費醫師34名(含婦產科2名)、協調高雄長庚醫院、奇美醫院及三軍總醫院三家醫學中心的21人次急重症專科醫師支援。
藉由上開計畫已協助澎湖地區三軍總醫院澎湖分院及衛生福利部澎湖醫院均成為中度級急救責任醫院，轉診量逐年下降，102年底心血管照護中心成立後，截至本(104)年8月底於當地已進行227例心導管手術，提供在地民眾適切醫療服務。
105年起該部將賡續獎助協助三軍總醫院澎湖分院及衛生福利部澎湖醫院之急重症相關補助及醫師人力支援，甚至引進更多醫學中心的支援，特別強化婦產科及兒科之醫師人力支援，三軍總醫院澎湖分院負責「外傷」與「高危險妊娠及新生兒照護」、衛生福利部澎湖醫院負責「心血管」與「腦中風」照護，兩家醫院互相合作、共同成長，以提供澎湖地區更好之急重症醫療品質。