衛生福利部一向亟為關心醫師的工作負荷，從100年起即針對住院醫師照顧床數與值班數進行規範，規定住院醫師每人每日照護床數至多15床，值班平均不超過3天1班，目前醫院均符合規範。五一勞動節將至，衛福部重申，維護醫師勞動權益的立場不會改變，將持續推動各項措施，改善醫師執業環境，提供民眾良好的醫療服務。
在住院醫師工時管制方面，衛福部自102年即訂定「住院醫師勞動權益保障參考指引」，規範每週工時上限88小時，兩次值勤中間至少10小時以上休息時間，並於104年起列入縣市衛生局督導考核的重點查核項目，結果醫院100％符合要求，衛福部於104年進一步將工時規定列入教學醫院評鑑必要項目，如未能通過該必要條文，則教學醫院評鑑為不合格，將影響醫院各項資格與給付。
衛福部自104年度起更透過獎勵措施，辦理住院醫師工時改善獎勵計畫，擇定工時現況較高之急重難症科別進行改善獎勵，共有38家醫院參與，這些醫院93.9%之科別均已達成降低2小時之補助標準。105年起又發展住院醫師工時回報行動應用程式(Apps)，由住院醫師自行填報工時資料。
除上述工時保障外，對於醫師們最為關切的職業災害補償機制，亦於104年列入教學醫院評鑑項目，此要求大幅提升醫院對於職業災害保護之重視。經調查顯示，目前96％醫院住院醫師、100％主治醫師享有公勞保職業傷病及失能保障，除此之外，另有53％之醫院另行購買商業保險，提高醫師保障。
此外，102年訂定之「住院醫師勞動權益保障參考指引」，亦要求雙方對於資遣等事項之約定，需陳報衛生局。經調查結果，81％醫院住院醫師、99％主治醫師已享有公勞保退休、失業保障。
對於醫師工時下降、職業災害補償、退休資遣納入勞基法保障這件事情，衛福部極為重視，但由於人口老化、民眾就醫習慣等問題，醫療需求不斷提高，依據國衛院調查顯示，目前如以勞基法84條之1約定工時88小時，預估不足326名住院醫師、要求78小時則不足1,519名，人力不足將使偏鄉地區民眾就醫權益首當其衝。對此，衛福部自105學年度起辦理「重點科別培育公費醫師制度計畫」，每年增加100-200名公費醫學生，培育內科、外科、婦產科、兒科及急診醫學科等專科人力，以挹注偏鄉人力；另每年預定增加培育800名專科護理師，協助醫師常規性臨床照護工作，以減輕住院醫師工作負擔。
衛福部也積極推動整合照護模式發展，鼓勵醫院聘更多主治醫師照顧病人，減輕住院醫師負擔。104年度已有19家醫院參與專責主治醫師整合照護推廣計畫，共有103名專責主治醫師投入。衛福部以階段性之作法，推動各項配套措施，並整合各界想法及進行溝通，期在確保民眾就醫可近性與醫療品質無虞的前提下，積極推動住院醫師納入勞基法之目標，期盼各界共同努力。