為營造兒童友善就醫環境、提升我國兒童醫療品質，衛生福利部已將設置兒童醫院，強化兒科病人重難症照護，列為重要政策目標。除於102年3月27日已公告修正兒童醫院之「醫療機構設置標準」、「兒童醫院評核作業程序」與「兒童醫院評核標準」，並已於103年3月20日召開「兒童醫院設立申請案」審議會議，初審通過台大醫院、台北馬偕紀念醫院、中國醫藥大學附設醫院、彰化基督教醫院等4家醫學中心級醫院分設兒童醫院，該等兒童醫院並可望於今年正式開業掛牌，確實是今年兒童節送給兒童特別有意義的禮物，更開啟我國兒童醫療的新紀元。
為兼顧醫療資源有效運用，衛生福利部特別於103年2月25日召開專家會議，研議兒童醫學中心的合理家數，會議結論重點為：兒童醫學中心之設立有其必要，但家數不宜過多，以北、中、南各1家為原則，並得考量兒童人口數及兒童重難症就醫分布，適度調整上限家數。另除兒童醫學中心外，亦鼓勵現有醫院可朝重點科別或特色醫療方向發展，衛生福利部將適時研議與各醫學會合作規劃辦理認證。
近年來，衛生福利部對於守護兒童健康不遺餘力，除上開作為，亦採取下列多項措施來提升兒童醫療照護品質及就醫可近性：1.陸續調高兒童醫療的健保給付2.補助醫療資源不足地區24小時的兒科醫療3.額外提供訓練滿一年的兒科住院醫師一年12萬元津貼。未來，年底前更將完成兒童重難症醫療之網絡，初期先以兒童癌症、兒童外科、兒童加護病房（PICU）、新生兒加護病房（NICU）、兒童心臟及遺傳疾病等6項醫療服務，建構國內兒童友善就醫地圖，使兒童照顧者能即時運用國內具兒科特色醫療服務之資源，作為就醫選擇的參考外，亦期有助於醫院間計劃性的轉診，落實分級醫療，進而與兒童醫院之設立相輔相成，使國家整體資源得以做最有效的運用。