針對103年6月3日自由時報報載：「自經區國際醫療全台恐都變專區」，並非事實，且甚多誤解，衛生福利部再次提出嚴正說明：
　　自由經濟示範區全台只會設立一至二處國際健康產業園區，絕對不會全台遍地開花，根據國外經驗也都擇一至二區設立而已，例如：韓國在仁川及濟州二處設立，杜拜有設立一處。雖然台灣諸多縣巿表示對自由經濟示範區的支持，但「自由經濟示範區特別條例」還在立法院審議中，本部更未接受申請。待條例通過後，衛生福利部將成立評選委員會，若有超過二個以上縣巿申請設立時，由評委會依各縣巿提出的專案內容，選出最具產業前景及最佳回饋民眾方案者優先考量。
　　自由經濟示範區限制設立國際健康產業園區數量之用意，即是防止過多醫療資源及醫事人力流入該園區，以維護民眾的就醫權益，配套的限制措施包括：醫師兼職時數的限制、不准使用健保、限制醫療機構家數及床數等，衛生福利部會確實把關。