本次0206震災，根據本部緊急醫療救護系統(EMS) 截至今(2/12)日中午12時統計資料，送醫救治共559人(台南市507人、高雄市36人、嘉義市7人、嘉義縣4人、彰化縣3人、雲林縣1人，台北市1人)，分布於7縣市34家醫院，其中9人已由醫療院所通報死亡(均為台南市)。489人已出院(台南市440人、高雄市33人、嘉義市7人、嘉義縣4人、彰化縣3人，雲林縣1人，臺北市1人)。目前住院人員70人(臺南67人，高雄3人)，其中臺南加護病房13人(成大6人、永康奇美7人)，一般病房53人(衛部南5人、衛部南新化分院4人、台南市醫2人、成大14人、臺南高榮12人、臺南新樓2人、永康奇美10人、麻豆新樓1人、安南醫院4人)，轉院1人。
今日馬英九總統一早即率領衛福部蔣丙煌部長，醫事司王宗曦司長與社工司李美珍司長，首先前往衛福部立臺南醫院新化分院，探視本次震災受傷3位民眾，再至部立臺南醫院探視2名受傷民眾。總統於現場一一慰問、關心受傷的民眾，並仔細詢問民眾及家人的需要。總統接續前往部立臺南醫院，探視本次震災另2位傷者，並於關懷民眾同時，表達政府將全力支援的態度。馬總統並於聽取院方收治病患之簡報後，除大力肯定部立醫院全力收治病患之努力，並當場對值班醫護人員之辛勞表達敬佩。
行政院張善政院長亦率領衛福部許銘能次長，探視奇美醫院仍在加護病房之林素琴小朋友，為他加油打氣，並致贈林小朋友受困61小時獲救後最想吃的甜點，鼓勵林小朋友早日恢復健康。
蔣丙煌部長指示，全力協助傷者恢復健康，並適時提供民眾各項身心協助。衛福部仍將持續維持最完善的緊急醫療準備，整備後續傷殘復建及身心治療的醫療資源與需求，全力協助災區救助與後續重建工作，並主動提供各項心理關懷與諮詢服務。
衛福部緊急醫療應變中心(以下簡稱REMOC)持續進行震災後的緊急應變工作，與各家急救責任醫院密切聯繫、掌握災難現場與傷患資訊，定時彙整更新。南區與北區REMOC除協助永康維冠大樓災區現場醫療救護站設置與營運，提供醫療諮詢協助，並與南區國家災難醫療救護隊(NDMAT)合作，NDMAT除提供照明，帳篷等支援設備，醫護人員、EMT甚至志工主動積極於現場協助醫療諮詢及醫療站設置，並運用救災專業知識，隨時提供救災現場安全即時建議，做為災害現場安全維護之重要參考。
衛福部再次感謝各界協助，並特別感謝此次參與傷患救治之醫事人員，在傷患搶救過程與後續照護中發揮至關重要之關鍵作用，並請醫護人員注意身心健康，如有不適症狀應請即刻休息或就醫。衛福部官網(www.mohw.gov.tw)已設立「0206震災專區 - 災後復原重建相關民眾濟助事項一覽表」專區，並成立諮詢專線供各界查詢運用，歡迎民眾多多利用。