醫師的專業服務與病人的就醫權益息息相關，薪資待遇亦不同於一般受薪族及勞工。鑑於醫師工作之高度專業性，及醫療服務之實際需求與特殊性與一般行業不同，為了讓住院醫師的訓練及工作條件更臻合理，並在不減損民眾就醫權益之原則下，衛生福利部已積極採循序漸進的方式，將工時規範、延長工時、休息時間及職業災害補償等勞動權益相關規定法制化，以多管齊下的方式改善住院醫師勞動條件。
衛生福利部表示，認同住院醫師工作權益應以勞動基準法精神給予保障，在平衡醫事人員勞動權益與病人權益的前提下，朝向相關規定法制化之方向改善勞動條件，包括：
壹、值班照顧床數合理化:衛生福利部參考美國醫師工時及值班之規定，修訂教學醫院評鑑基準，並自100年起規定住院醫師每人每日照護床數上限為15床，值班訓練平均不超過3天1班，並於102年進一步將住院醫師工時及休息的規定納入醫院評鑑試評項目。
貳、訂定住院醫師工時規範：衛生福利部已於102年5月16日頒訂「住院醫師勞動權益保障參考指引」，請各衛生局督導查核轄區教學醫院與住院醫師依照參考指引的規定簽訂契約事宜，並將住院醫師工時及休息規定，列為104年教學醫院正式評鑑項目及各縣市政府衛生局醫政業務督導考核項目。其中工時部分規定：(一)比照美國的標準，每週正常工作時間連同延長工作時間不得超過88小時；(二) 每日正常工作時間不得超過12小時，連同延長工作時間不得超過一定時數（24~32小時不等）；(三) 兩次工作時間中間至少應有10小時以上休息時間等。
?、建立相關人力配套部分：逐年增加專科護理師人數，協助醫院內主治醫師及住院醫師輔助常規性臨床照護工作。
肆、改善五大科（內外婦兒急）的住院醫師人力：
(一)五大科（內外婦兒急）的住院醫師人力回流: 衛生福利部自102年起推出提高全民健保五大科別支付標準、增加五大科住院醫師津貼等12項策略後，住院醫師招收情形已明顯改善，103年度的招收率均已回到8成以上，其中兒科與急診科更達100%。
(二)逐步調整部份科別專科醫師訓練員額。針對某些專科(如五大科）因為需要安排24小時急診會診而致人力不足的情況，以及偏遠地區急重症專科醫師的不足，衛生福利部已逐年檢討訓練容額。
伍、推廣專責醫療主治醫師照護制度計畫(Hospitalist)：本部已參考先進國家之作法，規劃辦理專責醫療主治醫師制度之試辦計畫，經由本計畫之試辦使接受過完整專科訓練的主治醫師，在合理的工作時數下，提供住院病人全人照護，促進病人安全，減輕住院醫師工作負荷，使醫療資源獲得最佳的運用，增進醫療品質。
陸、勞動權益法制化研議：衛生福利部考量優先以修訂醫療法，將現有保障醫師工作時間的規定予以法制化，並明定醫師職業災害補償參考適用勞基法規範，並且研議提高相關罰則，保障醫病雙方之權益。
綜上，鑑於前開政策之規劃執行，攸關病人安全及照護品質等權益，須審慎周延，尚非一蹴可幾。衛生福利部期在確保及維護大多數民眾現行的就醫水準與品質的前提下，以系統性解決、分階段執行之方式達成目標，兼顧醫病雙方之權益，期盼各界共同努力並惠予支持。