衛福部與各縣市衛生局通力合作啟動流感應變醫院及醫療調度機制，再增加部立彰化醫院(A級)、彰濱秀傳紀念醫院(A級)及高雄阮綜合醫院(B級)等3家，共計29家，並已建置轉診機制協助分流收治，民眾亦可分散就醫，以減輕擠入醫學中心的壓力。截至統計今(6)日上午10時止，共有8家醫院(41次)等待加護病床人數超過5人，分別為三軍總醫院(1次)、臺中榮民總醫院(7次)、中國附醫(5次)、奇美醫院(10次)、成大醫院(8次)、林口長庚(6次)、高雄長庚(2次)、嘉義基督教醫院(1次)、臺北國泰醫院(1次)； 考量醫院收治狀況與民眾轉診意願後，啟動應變分流27次(林口長庚4次、台中榮民總醫院3次、奇美醫院9次、成大醫院7次、高雄長庚2次、嘉義基督教醫院1次、臺北國泰醫院1次)。

迄今除3/4衛福部部所屬醫院已接受各壅塞醫院轉診之流感重症個案14人(嘉義醫院6人(嘉義基督教醫院4人、聖馬爾定醫院1人、新樓醫院1人)、臺南醫院7人(成大醫院)、屏東醫院1人(安泰醫院))，今日台南市衛生局亦已協助成大醫院轉診2人至柳營奇美醫院與台南新樓醫院，高雄市衛生局亦協助高雄長庚轉診1人至國軍高雄總醫院。

本部2/24起與中華民國體外循環技術學會合作，由該會協助調查葉克膜(ECMO)運用事宜，根據今(6)日上午10時統計，全國129部葉克膜47台尚可使用，其中全國36家重度級急救責任醫院有107台，29台可使用。考量各院ECMO使用狀況隨時變化，且院內可能已有病人等待使用，因此衛福部REMOC已將葉克膜空機統計情形轉知地方衛生局及各重度級急救責任醫院，提供醫院進行聯繫、調度或轉診之參考，地方衛生局亦可協助協調。經昨日訪視，各醫院均無缺乏葉克膜。且經本部醫事司聯繫後，中華民國醫師公會全國聯合會、中華民國體外循環技術學會、台灣胸腔及心臟血管外科學會與中華民國心臟學會，均同意協助會員間協調與溝通等事宜。

衛福部透過緊急醫療救護系統(EMS)掌握全國加護病床空床數資源，並持續與地方政府衛生局召開「因應流感疫情協調急診壅塞相關事宜研商視訊會議」，共同攜手防治流感，督導與協助轄區急救責任醫院之加護病房、人力與葉克膜調度，以確保醫療量能，避免影響緊急醫療運作，保障民眾醫療權益。