衛生福利部依醫療法第28條規定辦理醫院評鑑，主要目的在於確保「病人權益」與「醫療服務品質」，以讓民眾受到妥善之醫療照護。104年起，醫院評鑑已由簡化、優化、日常化三面向進行改革，9成以上醫院反映，評鑑制度確有改善。
新版醫院評鑑（104年至107年適用）制度之改革目標係導入「以病人為焦點之查證方式（Patient Focus Method，PFM）」，藉由現場查證病人之照護流程，評核醫院之醫療品質，以降低干擾醫院日常作業，改革方向從「簡化」、「優化」、「日常化」著手。
(一)「簡化」：評鑑條文基準已由原238條減少為188條，簡化文書作業，宣導以無紙化或平常作業方式呈現資料，降低醫護人員準備評鑑之壓力。
(二)「優化」：導入Patient Focus Method(PFM)查證方式，藉由查證醫院日常作業，對照評鑑條文基準予以評核，取代書面資料查閱，使醫院評鑑更貼近病人照護面。
(三)「日常化」：為避免醫院以非平常作業方式來應付評鑑，本部已建置持續性監測指標系統，並於醫院評鑑條文另訂「持續性監測指標」，醫院每半年填報一次，以日常醫院作業情形方式呈現，評鑑委員於實地評鑑前會詳讀醫院填報之相關資料（如：基本資料表、持續性監測指標數據及質性文件等），防杜醫院為評鑑而作假之情事。
為避免評鑑人力不實，醫院人力配置，已列為評鑑項目必要條文。採評鑑當日人力與評鑑前年平均人力二項指標評核，需同時符合才合格。同時為不定時監控醫院品質，當年度非參與評鑑醫院，以追蹤輔導訪查作業、與地方政府衛生局合作進行相關督導考核等方式，持續維護醫院之醫療服務品質與病人安全。
經努力，醫院評鑑已打破病床規模、科別設置之醫療品質分級迷思，已從結構面轉為加強過程及結果面之評核，對於整體醫療品質之具體提升及醫療體系的運作，具有實質效益。