因應衛生福利部組織成立，將原醫事處設置「醫事司」，分六科辦事，法定職掌如下: 
一、醫事人員管理與醫事人力發展政策之規劃、推動及相關法規之研訂。 
二、醫事機構管理政策之規劃與推動及相關法規之研訂。 
三、醫事品質、醫事倫理及醫事技術之促進、管制及輔導。 
四、緊急醫療救護服務體系之規劃及推動。 
五、醫療服務產業之輔導及獎勵。 
六、醫事服務體系之規劃及推動。 
七、醫事人員懲戒及醫事爭議處理。 
八、其他有關醫事服務管理事項。