衛生福利部依據「嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例」第二條規定，於4月14日修正公告「執行嚴重特殊傳染性肺炎醫療照護及防治發給補助津貼及獎勵要點」，擴大津貼及獎勵對象，並於4月24日公布申請作業須知，相關補助、津貼、獎勵方案整理如附表，另外，亦持續爭取預算滾動修正，以實質鼓勵投入防疫工作之第一線人員辛勞，守護國人健康。

       衛福部表示，為落實醫院感染管控措施，排班方式以分艙分流、專責照護為原則，優先獎勵第一線醫事人員。津貼發給對象為設有負壓隔離病房、普通隔離病房、加護病房或專責病房，第一線執行照護疑似或確診病例的醫事人員，包含醫師、護理人員、專任感染管制人員及醫事放射人員。計算基準以病房為單位給予津貼，專責醫師每人每日1萬元、專責護理人員每人每班1萬元、專責醫事放射人員每人每月1萬元、專任感染管制人員每人每月1萬元。但為考量排班及照護品質，隔離病房、專責病房之每名醫師以每日照護不超過十床為原則，可採日夜輪班方式申請；護理人員以每人每班照護不超過五床為原則(優於醫學中心評鑑標準之護病比1:7)，可採每日三班方式申請。加護病房之專責醫師，採日夜輪班方式申請；護理人員以每人每班照護二床為原則，採每日三班方式申請。

       津貼申請作業須知，已於4月24日發函各醫院，由醫院按月核實造具人員津貼發給名冊及班表，發放期間並回溯至1月15日起之收治個案，因此，本年1月至3月津貼，請於5月20日前向本部提出申請以利發放。此外，待立法院預算審查通過後，將參採各界意見盡速修正公布更多獎勵方案，研議依收治病人數、病情嚴重度及住院天數給予額外獎勵，且全數分配予第一線及共同照護之醫師; 例如無嚴重肺炎徵候之肺炎患者每人日加發2,000元，嚴重肺炎患者每人日加發4,000元，使用呼吸器患者每人日加發8,000元，使用呼吸器且敗血症患者每人日加發1萬元。此外，也會有針對急診醫護人員及基層院所的獎勵方案，使投入防疫之醫療機構與人員獲得應有之鼓勵。