99-101年辦理「加速醫療院所實施電子病歷系統計畫」，並於102年至104年續辦「電子病歷互通應用補助計畫」，期間每年度持續編列預算推動，以加速醫院實施電子病歷及互通。參與實施電子病歷及與電子病歷交換中心介接之醫院名單，歡迎上網(電子病歷推動專區及電子病歷交換中心)查詢。目前可提供醫療影像及報告類、血液檢驗類、出院病摘類及門診病歷類等4類交換服務。

本部除繼續推動醫療院所實施電子病歷及互通外，並已規劃台灣健康雲計畫，及發展電子病歷雲端服務，增加國內醫療院所推動電子病歷之意願。

電子病歷推動專區 網址：https://emr.mohw.gov.tw

電子病歷交換中心 網址：https://eec.mohw.gov.tw/