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• 部長室
• 主任秘書室
• 綜合規劃司
• 社會保險司
• 社會救助及社工司
• 護理及健康照護司
• 保護服務司
• 醫事司
• 心理健康司
• 口腔健康司
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• 法規會
• 全民健康保險會
• 全民健康保險爭議審議會
• 國民年金監理會
• 國際合作組
• 科技發展組
• 國會聯絡組
• 長期照顧司
• 國家消除C肝辦公室
• 附屬醫療及社會福利機構管理會
• 衛生福利人員訓練中心