依據衛生署疾病管制局監視資料顯示，國內腸病毒71型已兩年餘未見流行，最近該型病毒活動情形有上升趨勢，導致部分縣市重症疫情升溫。依據該局一項研究計畫發現，國內3歲以下幼兒約有90%以上不具該型病毒抗體，即對該型病毒感染無保護力，若該型病毒活動情形持續上升，推測本年可能會有較大規模的流行。本（2008）年截至1/29止，共通報疑似腸病毒感染併發重症19例， 6例為確定病例，檢驗結果均為腸病毒71型。由於腸病毒71型也是造成腸病毒重症死亡最主要的病毒型別，雖然目前並非歷年腸病毒流行的高峰期，但因年關將屆，家族聚會及外出旅遊皆增加嬰幼兒暴露病毒的機會，因此該局再次呼籲全國100多萬家有5歲以下幼兒的家長注意兩大預防重點：一、避免嬰幼兒被感染；二、有疑似重症徵兆，要儘速轉送重症轉診醫院。
同時為確保疑似腸病毒重症患者醫療品質，衛生署侯署長已責成相關單位務必妥善因應，由醫事處建立各級醫療院所小兒加護病房緊急調度聯絡網，督導及維護各級醫療院所急診醫護品質，及提供有關腸病毒患者醫療處置指引予各級醫療院所，由醫院管理委員會督導署立醫院維護急診醫護品質，亦提供有關腸病毒患者醫療處置指引予各署立醫院，另請衛生教育推動委員會提早啟動各項衛教宣導活動，健保局持續協助以健保電子報提升醫師診治警覺，並請相關醫學會主動、協助辦理腸病毒醫護專業訓練，維護腸病毒病患醫療品質。
該局再次提醒民眾，日常生活中要特別注意自身與嬰幼兒的衛生，自外面回家後，在摟抱、餵食嬰幼兒前，大人及小孩務必正確洗手，避免嬰幼兒感染為防治首要。若家中嬰幼兒經醫師診斷感染腸病毒時，要注意觀察患者是否出現腸病毒感染併發重症的前兆病徵，如有嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力、肌躍型抽搐、持續嘔吐、持續發燒、煩躁不安、昏迷、頸部僵硬、肢體麻痺、抽搐、呼吸急促、心跳加快等疑似腸病毒重症症狀時，請務必立即就醫，儘速接受適當的治療，以免錯過治療的黃金時間；坊間診所臨床醫師看診時，如發現幼童出現重症前兆病徵，亦應建議家長儘速轉診至57家腸病毒重症轉診醫院（如附件）急救，以免延誤病情。
「不恃敵之不來，恃吾有以待之」，國內自1998年發生腸病毒大流行，造成78名幼童死亡後，10年來，腸病毒一直是傳染病防治的重點，衛生署已建立多元化腸病毒監測系統，以掌握腸病毒流行趨勢，並邀請臨床專家，建立諮詢管道，提供醫療諮詢服務，亦建立腸病毒感染併發重症醫療處理原則，提供第一線醫師治療重症病患的依循，有效提升醫護品質，降低重症死亡率，此外，該局邀請曾任職美國CDC腸病毒專家學者回國?任研究員，強化腸病毒研究檢驗能力，目前國內在腸病毒快速檢驗技術能力開發，已獲致不錯成效，能有效縮短檢驗時程，提供快速防治之需。
若要獲得更多腸病毒防治常識，請至該局全球資訊網，進入「防疫專區/疾病介紹/第三類傳染病－腸病毒感染併發重症」，可查詢疾病介紹、預防保健、治療照護與防治政策等相關資訊，或多利用該局民眾疫情通報及諮詢服務專線：1922，也可就近洽詢所在地衛生局。