行政院為整合各部會資源，加速災區復原重建進度，妥適照顧災民，於2月14日召開「0206震災優先處置事項研商會議」，由衛生福利部、內政部及經濟部等各相關部會就災害應變及災後重建等後續工作進行報告。
衛生福利部是日由部長蔣丙煌率相關司處主管出席與會，於會中報告本次震災收容安置及救(賑)助金發放情形，並就後續短期、中長期受災戶安置及生活重建規劃，進行說明。除了持續督請臺南市政府做好災民收容安置，加速相關救助金慰問金發放外，也請臺南市政府以「一戶一社工」方式，指派社工人員，對每一受災戶提供關懷，評估需求並轉介相關資源。另外，也發動志工團體持續提供受災戶各項關懷服務工作。此外，衛生福利部自2月6日至4月30日受理民眾愛心捐款，以協助受災民眾後續醫療、生活重建所需經費，並加速處理相關民間團體勸募許可。
截至今(14)日上午6時，臺南市尚有13處收容場所，收容109人，另自震災發生至今，已動員社工共計1,226人次，分別在維冠大樓災害現場、殯儀館、災民安置處所及醫院等地，每日由社工24小時駐點服務，提供福利諮詢，並陪伴災民及罹難者家屬共渡難關。另佛教慈濟慈善基金會、法鼓山慈善基金會及一貫道等社會福利慈善團體，亦動員志工於災害現場協助物資發放、餐食及關懷支持等服務項目，截至2月14日止，志工出勤累計6,423人次。
行政院院長張善政於會中裁示，請衛生福利部加速死亡慰問金發放，及加強對災民及救災人員後續心理重建輔導工作。衛生福利部後續將俟臺南市政府確認死傷名單及領取順位，於完成認定後儘速發放，以利災民後續復原重建工作。