衛生福利部心理健康司為我國心理健康與精神醫療政策之主管機關，負責政策規劃、推動、監督及法規研訂，涵蓋健康促進、疾病防治、權益保障與醫療服務等領域。主要職掌包括： 

一、心理健康促進與自殺防治，整合跨部門資源，推動全國心理健康促進與自殺防治計畫，研訂法規並建立多層次支持與危機介入機制。 
二、精神疾病防治與病人權益保障，規劃預防、治療、復健與復元政策，研訂保障病人平等、尊嚴及高品質照護的法規，落實去汙名化與社會接納。 
三、精神醫療與復健機構管理，訂定設立標準、服務規範與評鑑制度，確保專業水準並推動社區化、多元化與復元導向服務。
四、毒品及其他成癮防治，規劃政策與法規，結合醫療、司法及社政體系，提供戒治、減害與復歸方案。 
五、家庭暴力、性侵害、性騷擾及涉及兒少保護事件中加害人之處遇與預防，研擬並督導跨網絡計畫，降低再犯風險並提升社會安全。 
六、司法精神醫療，推動司法精神醫療服務體系與機構管理，確保司法與醫療間銜接。