依據疫情監視資料顯示，目前腸病毒流行疫情尚在高峰期，對嬰幼兒健康所構成的威脅仍不可輕忽。腸病毒中央流行疫情指揮中心再度呼籲家有嬰幼兒的民眾，及教保育機構，務必要隨時注意個人、嬰幼兒及學童之衛生健康情形，不論大人或小孩，都要保持良好衛生習慣，自外面回家後，在摟抱、餵食家中嬰幼兒前，務必正確洗手，降低將腸病毒傳染給嬰幼兒的機會。
該中心表示，一名居住於雲林縣之4個月大女童，自6月16日起出現發燒、手足口病、嘔吐等腸病毒感染症狀，於6月17日就醫，此後兩天，發燒症狀未改善，但食慾及活動力正常，6月20日開始出現抽搐與心跳過速的情形，隨後出現肺出血、呼吸困難及心跳減緩等症狀，經3小時急救後仍不幸死亡，院方立即通報疑似腸病毒感染併發重症，並經檢驗證實係由腸病毒71型感染所致。本（2008）年截至6月25日止，重症確定病例計有260例，其中219人已出院，32人仍在住院中，9人往生。
由於腸病毒重症的病程變化很快，所以若家中嬰幼兒經醫師診斷感染腸病毒時，要注意患者是否出現腸病毒感染併發重症的前兆病徵，如有持續發燒、煩躁不安、嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力、肌躍型抽搐、持續嘔吐、頸部僵硬、肢體麻痺、昏迷、呼吸急促、心跳加快等疑似併發重症的跡象時，請務必儘速就醫接受治療，掌握治療的黃金時間；坊間診所臨床醫師看診時，如發現患者出現腸病毒重症前兆病徵，亦應儘速協助轉診，以免貽誤病情。目前腸病毒重症責任醫院共有65家，如有轉診必要，或相關病床調度事宜，院方均會負責協調聯繫，傳染病防治醫療網各區指揮官亦會主動協助。