國內為了預防流感大流行造成的衝擊，除已有相關因應措施的規劃，並已建置多元監測系統，及儲備相關抗病毒藥劑、個人防護裝備等防疫物資。在人體監測部分，截至12月16日止，本年共計通報8例人類H5N1疑似病例，其旅遊史有2例到過中國大陸，1例到過越南，另5例係屬為國內禽畜相關接觸人員，檢驗結果為3例A(H1)、2例A(H3)，均為常見的季節性流感病毒，另有3例陰性。故截至目前為止國內並無H5N1流感疫情。
至於禽流感病毒H5N2亞型與H5N1亞型不同，對人體沒有健康危害的證據，至今科學文獻或世界衛生組織都沒有任何H5N2人類病例的報告。H5N2流感病毒的感染在禽鳥中常見，但並無在人類發生症狀，且所謂「高病原性」禽流感病毒係指針對禽鳥類，並非針對人類而言。即便如此，疾病管制局均配合農政單位，加強各項防疫措施。
禽流感病毒存在於感染的動物或其排泄物中，人類因吸入或接觸眼鼻黏膜而致病，根據世界衛生組織公佈之人類H5N1禽流感確定病例中，高達60%以上的病患有禽鳥接觸史，因此國人至H5N1禽流感流行地區旅遊(尤其是香港、大陸江蘇省、印尼、埃及、柬埔寨等有禽或人類疫情地區)，應避免接觸禽鳥，並應遵守下列預防方法，避免感染：
1.避免接觸禽鳥及其排泄物，若不慎接觸應馬上以肥皂澈底清潔雙手。
2.避免生食禽類製品（包含蛋類及相關產品），烹調食物最少需加熱至70℃。
3.出外旅行要避免到生禽宰殺場所、養禽場、活禽市場或農場參觀，且勿攜帶禽鳥回國。
4.若出現發燒及類似感冒症狀，應戴上口罩並立即就醫，並告訴醫師旅遊史及禽鳥接觸史。
5.保持室內空氣流通，咳嗽、打噴嚏需遮掩口鼻，若出現發燒、咳嗽、喉嚨痛等呼吸道症狀，儘量不上班、不上課。
6.勤洗手，養成良好個人衛生習慣。
7.均衡飲食、適當運動及休息。
8.避免不必要的探病。