疾病管制局郭旭崧局長於本(98)年元月13日收到世界衛生組織(WHO)幹事長辦公室主任Dr. Bernard P. Kean，就我國參與「國際衛生條例」(簡稱IHR)執行方式之來函，表示WHO將接納我參與IHR並作相關安排。該局表示：該項安排有助於將我國納入全球疫情通報及防治體系，並與WHO直接聯繫互動，係落實IHR普世適用原則的第一步。本案在技術面是一項正面進展，該局表示未來將續與WHO就細節聯繫協調，確保該項安排得以順利執行。
IHR自2007年6月15日開始適用，目前是WHO推動之重點工作。倘由全球疾病或公共衛生緊急事件之防堵觀點而言，對於WHO將我國正式納入IHR運作體系，即全球疾病防治體系之一環，該局對此進展表示肯定，對後續發展亦樂觀其成。
針對WHO就我國實質參與IHR提出之作為，包括(1)接受我方指定聯繫窗口；(2)WHO窗口與我窗口互可直接主動進行聯繫；(3)提供我方密碼登錄「公衛事件資訊網站」；(4)倘我方發生國際公共衛生緊急事件，WHO可派遣專家協助、邀請我方人員出席WHO緊急委員會；(5)請我方推薦專家納入WHO IHR專家群等5項，郭局長表示，WHO提出之5項作為是IHR執行時最重要的要件。惟對於未來我方窗口與WHO窗口之互動模式、推薦專家之領域等相關技術性細節，仍需進一步與WHO洽商、研議。
郭局長認為，IHR並非WHO活動之全部，此案無法取代WHA觀察員，因此，我國仍將持續爭取成為WHA觀察員。
此外，郭局長也指出，我國現正式被納入IHR，代表我即可直接與WHO聯繫，且可與國際同步，取得國際間之緊急公共衛生事件例如SARS、禽流感疫情、化學災害、食品安全危害等第一手資訊，故有助於提昇我疫情監測及預警能力；而倘若台灣發生國際間緊急公共衛生事件，WHO專家也可來台提供協助並與我共同執行相關防治措施；我國專家也有機會出席WHO召開的委員會，一起商議如何防範在我國或其他國家發生的緊急事件，以提昇我疫情應變能力，確保國內民眾之健康安全及減少經濟損失。
「國際衛生條例，簡稱IHR」係國際間為防止疾病散播所制定之策略準則，於2005年5月23日第58屆世界衛生大會修正通過，2007年6月15日生效及實施。該條例共分為前言、10個部份、66項條文及9個附件，四大主要修正重點包括(1)擴大通報國際關注之公共衛生突發事件；(2)加強流行預警及應變；(3)增加IHR國家對口單位；(4)增加對監測與應變能力的基本要求。WHO為順利推行IHR，業於2007年6月11日公告各國應備妥之條件：(1)各國均應設置一個「IHR國家對口單位」；(2)各國應自行評估國內公共衛生事件是否達到通報WHO之標準；(3)各國應評估及強化國內因應公共衛生緊急事件之能力，包括全面使用新式書表、確實檢視及修正國內法規，以符合IHR規範等要求。
我國雖因非WHO會員，而遲遲未能成為IHR締約國，惟行政院衛生署為與國際接軌，同步實施IHR，自2007年6月15日起，即配合IHR規定，推動相關防疫新措施，包括(1)指定疾病管制局為「IHR國家對口單位」，與國際交換疫情資訊；(2)修訂傳染病防治法，以符合IHR規範；(3)使用評量表自行評估國內公共衛生事件，是否達到通報WHO之標準；(4)檢視及提昇國內緊急應變能力，以強化疾病監測與防治量能。