依據健保法規定，衛生署全民健康保險醫療費用協定委員會（以下簡稱費協會）負責健保醫療給付費用總額（醫療費用支出）之協商，其由醫事服務提供者代表、保險付費者代表與專家學者，及相關主管機關代表各占三分之一所組成。今日，民間團體質疑該會之保險付費者代表中，潛藏著醫藥界人士乙節，衛生署表示，費協會代表係由各團體及單位所推薦，基本上予以尊重，該署並希望各代表於參與會議時，均能恰如其分，代表個別團體發言。
費協會是付費者、醫事服務提供者及政府機關代表協商每年醫療支出的平台，歷次的會議協商過程均秉持相互尊重原則，作溝通與討論。目前，該會運作並無所謂向醫藥界傾斜之情形。
至於民間團體建議費協會的會議紀錄應透明公開乙節，費協會表示，本於資訊公開透明的目標，目前該會之會議紀錄均已主動公布於網站。另外，去(97)年5月及7月之兩次會議中，委員們曾進行討論。在配合相關法令規定之下，費協會將朝委員發言摘要可提供調閱之方向規劃。