針對我國獲邀參加本屆世界衛生大會(WHA)一事，本署委託蓋洛普民意調查公司進行民意調查，以了解民眾對我參加WHA的看法。調查結果發現，九成三的民眾認為我國參加WHA，對我國傳染病防治與醫療衛生有幫助。近九成的民眾贊成我國以觀察員的身分參加WHA，並有四分之三的民眾贊成以中華台北的名義參加本屆大會。其次，有超過五成的民眾不擔心參加WHA有矮化我主權的嫌疑，並有七成的民眾認為參加WHA符合我國的整體利益。

葉署長表示，世衛發言人亞伯拉罕(Thomas Abraham)在接受中央社訪問時表示，世衛祕書長對台灣的邀請，並不依照WHO的特定成文規定，而是本來就有權力邀請「執行公共衛生領域功能的實體」。因此，我方以觀察員的名義參與WHA，是國際社會對我國公共衛生成就的肯定。此次我國得以參加WHA，不能僅歸因於中國大陸的善意，更重要的是我方長年以來的努力，和國際友人如美國、日本與歐盟等國的支持。從本次民意調查中，民眾對我方參加WHA一事表現的高度支持來看，也是證明民眾對政府維護我主權有充分的信心。

本次民意調查的調查日期為2009年4月30日至5月1日，調查對象為台灣地區18歲以上知道「世界衛生組織(WHO)或世界衛生大會(WHA)的民眾」，調查樣本數為1,122人，有效信心水準為95%。