有關某媒體報導「日本於成田機場發現H1N1新型流感病例，未能及時通知我國，造成防疫漏洞」，並對日方有所指責乙事，中央流行疫情指揮中心作以下聲明：
日本進行機場及登機檢疫等工作，及時發現H1N1新型流感病例，對我國及周邊國家之防治工作助益甚大，我們對此表示肯定與感謝。發生相關事件時，政府部門在時間壓力下，需同時處理多項工作，疾病管制局對此亦有多次經驗，日方於此事件之處理，雖未十全十美，但已盡其全力，遠超過世界衛生組織(WHO)之規範。此時各方不宜多予苛責，應秉持相互體諒與合作之精神，共同為阻遏疾病蔓延努力。我國將持續與鄰近國家進行工作協調，以達合作無間、互惠互利之最高境界。
葉金川指揮官已指示查明事實原委，並特別強調：若有個人、團體或媒體於未能明瞭事件全貌之情形下，逕自公開發表指責外國政府之言論，導致破壞國際防疫合作之情事，將依法追究其法律責任。