為讓友邦國家人道救援物資可快速輸入至國內，衛生署已緊急通知財政部關稅總局、基隆關稅局、台北關稅局、台中關稅局、高雄關稅局，有關藥品、醫療器材（貨品分類表號列中帶有501、502、503、504…等輸入規定代號）進口報單填寫方式，簽審文件編號填寫”DH999999999999”號碼者，屬於國外救援物資，請各關稅局可優先處理通關，以便及時將救援物資送到災民手上。
衛生署已分別於8月13日及16日接獲來自新加坡、澳洲救災藥品與醫療器材等物資，新加坡政府捐贈品項有抗生素、止痛劑、點滴等藥品、消毒紗布、包紮用繃帶、民生用品等共33項，衛生署於13日辦理通關、點收手續後，立即交給物資調度指揮中心統一調度運至災區使用；另外澳洲政府於16日上午捐贈20萬顆氯錠、消毒水專用桶以及手動消毒機等，該批物資衛生署亦與環保署、外交部代表接收後，交由中華民國紅十字會立即使用於災區消毒。