因應本次莫拉克颱風造成南台灣地區重大災害，國民健康局表示，居住於災區民眾之健保IC卡有遺失或毀損者，在補發健保IC卡期間，需接受孕婦產前檢查、兒童預防保健服務、子宮頸抹片檢查、婦女乳房攝影檢查、兒童牙齒塗氟保健及成人預防保健服務時，可比照中央健康保險局發布「莫拉克颱風受災之民眾全民健保就醫協助方案」，由健保各特約醫療院所協助採用例外就醫程序之方式予以受理。對於孕婦健康手冊及兒童健康手冊遺失或毀損者，不用擔心手冊不見無法就醫，可以直接先到醫療院所接受產前檢查及兒童預防保健服務，醫療院所會當場直接補發，以供登載相關檢查資訊。
在此期間，國民健康局提醒孕媽咪們，仍應多注意自身的健康狀況，定期接受政府補助提供10次之孕婦產前檢查，以掌握母體的健康狀況與胎兒健康；在災難之後，不論是一般民眾或孕婦，都比較容易因為壓力而出現焦慮等症狀，故如孕期當中，發現不適症狀、異常徵兆或出現災後壓力創傷症候群，如：焦慮、害怕、無助感、失眠、焦躁不安、麻木、疏離等生理、心理反應時，應儘速至醫療院所接受進一步診療及諮詢。
此外，對於7歲以下之兒童，平時已透過健保特約醫療院所，補助提供9次之兒童預防保健服務（含身體檢查、理學檢查及發展評估）及保健諮詢與指導。因此，該局再次提醒家長，在重建家園之際，亦請妥善利用兒童預防保健服務，帶著家中幼兒前往就近設有兒科或家庭醫學科的醫療院所，接受兒童預防保健服務，以掌握兒童健康與發展。