依據疾病管制局的社區監測資料顯示，H1N1新流感病毒活躍，最近一星期之類流感病例數推估已高過1萬例，流行疫情指揮中心表示，現階段以防範重症個案及群聚事件的產生為防治目標，為了確保醫院可持續提供病患安全的就醫環境，並維護工作人員的健康，避免發生群聚感染與重症個案，所以各醫院應加強落實以下作業規範：
一、強力宣導有感冒症狀者進入醫院應戴口罩，並加強院內手部衛生督導查核事宜。
二、落實每日員工發燒或類流感症狀之監測，有病者除要求其居家休息外，並予以妥適治療。
三、落實類流感群聚事件通報機制，請即時通知轄區衛生主管機關。
四、一旦院內發生H1N1新流感群聚事件，應立即介入感控措施，並依機構既定之處理群聚事件標準作業流程，展開各項因應措施。
五、在臨床上，針對懷疑H1N1新流感感染者，應妥適診療，及早投予抗病毒藥物治療。
未來疫情若持續擴大，院內群聚事件發生不斷，甚至造成醫護人員重症個案，則指揮中心將會更強制性地要求各醫院執行更嚴格的措施，例如：出入醫院全面戴口罩，限制訪客人數及活動時間；關閉醫院美食街、商店街之營運；暫停外借醫院內會議室等空間供外部人員辦理各類聚集活動；院內員工之教育訓練宜以線上學習方式辦理，若須開課應要求學員戴口罩，另院內小型討論會亦應採取相關防範措施。
另外，指揮中心將會考量函請地方衛生局加強查核醫院執行感控措施情形，發現缺失應立即依法處罰並限期改善，如不改善且連續發生群聚事件，則不排除暫時關閉病房之作為，以利疫情處理。