日本來台協助這一次莫拉克颱風救災工作之緊急援助隊，專家小組一行5名成員，由該國之駐台代表齋藤正樹等日本交流協會人員，在我方外交部人員陪同之下，於98年8月28日上午到衛生署拜會，由楊署長志良及張副署長上淳接見。
這一次莫拉克颱風侵襲台灣，造成重大災害，潛藏防疫危機，日本政府特派遣其國際緊急援助隊之專家小組，於8月21至28日，來台協助我國防範災區傳染病之疫情管控，針對災情較為嚴重的高雄縣、屏東縣的災民收容所，衛生情況進行調查，並依據其過往國際救災經驗，針對當前傳染病之預防措施提出許多具體建議。
日本防疫衛生專家小組特別將這一次來台援助風災之過程與心得，向衛生署做簡單之報告，並送交報告書，且與衛生署疾病管制局和醫事處人員會談，針對災區衛生防疫問題，提供寶貴建議，進行意見交流。