針對蘋果日報98年9月4日A8版「災民輔導等嘸20萬經費」，提及「．．．衛生所申請緊急採購兩輛四輪傳動車輛，計畫已送衛生署，迄今也沒答案，衛生局人員焦慮不已．．．」等內容，該局申請購置四輪傳動車之計畫，係於9月2日傳真至衛生署，衛生署隨即於第一時間受理辦理，並無延誤時效。
衛生署針對莫拉克颱風災情之處理，均主動調查各地災情，了解災害狀況，同時並向行政院申請編列「莫拉克颱風災後重建特別預算」，以積極辦理衛生所、室因災害損失所需重建之經費。目前衛生署為因應莫拉克災後需求，以最快速方式辦理衛生所/室房設及設備修繕與重購置，並協調各災區醫院組成醫療團隊進駐，並持續以衛生所之巡迴醫療服務提供災區民眾所需。