指揮中心今（9/15）日召開第二十六次會議，由朱立倫總指揮官主持，計有27個部會代表參加，會議分別由教育部、衛生署等單位針對校園防疫現況、醫療照護等議題進行討論，並達成決議。
其中，教育部已針對各級學校校外教學（畢業旅行）新流感的防疫作為訂定處理原則，並要求各級學校依此原則落實辦理。至於進行中的校外教學（畢業旅行），如已發生H1N1新型流感案例的處置標準，請教育部儘速規劃。
對於醫院急診求診壅塞情形已明顯緩解，這也證明各縣市推動流感診所以及各大醫院開設流感特別門診的策略奏效。惟對於少數基層診所設置流感診所進度較差的縣市，請指揮中心加強督導改善。
朱副院長於9月11日由吳院長指派擔任指揮中心總指揮官，今(9/15)日第一次主持例行的指揮中心會議。指揮中心於4月28日成立，至今第141天。朱總指揮官於了解指揮中心運作後，要求各部會積極參與並配合指揮中心運作，並加強與地方之溝通。朱總指揮官也以「就醫普及、投藥及時、整體醫療照護落實」作為現階段指揮中心防疫目標。