對於外界建議頒布緊急命令，指揮中心今(10/26)日表示，依據疾病管制局疫情監視資料以及新流感防疫作為執行狀況，指揮中心評估目前無頒布緊急命令之必要，惟必要時將立即建請總統頒布。
　 為因應新流感流行疫情，行政院早於4月28日成立中央流行疫情指揮中心，統籌中央及地方各項防疫資源，積極執行相關防治作為。另總統府分別於8月23日及9月23日召開防疫專家諮詢會議，國家安全局及國安會亦自8月25日起派員參加指揮中心例行性會議，府院高層均隨時掌握疫情最新發展與應變作為。
經查我國於動員戡亂時期後，僅曾於1999年「921大地震」時，由總統依法頒布緊急命令，以有效徵調、徵用物資，進行救災與安置。而於2003年SARS疫情期間，並未啟動緊急命令。且於SARS疫情過後，政府已全面檢討修正傳染病防治法，目前已有相關法源依據，可適時啟動各項緊急應變措施。
對於美國歐巴馬總統於日前宣布全國進入新流感緊急狀態乙事，指揮中心表示已掌握，並將持續注意其發展。各國因應作為均有參考價值，但仍需考量國情差異與疫情狀況不同，避免過度作為，影響社會運作。指揮中心強調，入秋後，新流感疫情已觸底反彈升溫的趨勢，面對疫情政府一直不敢鬆懈，嚴陣以待，讓所有防疫作為井然有序的執行。