有關某媒體多次報導台中女高中生於疫苗接種後身體不適，其中指涉疾管局有踢皮球情形，該局特別提出澄清。
疾病管制局表示，其第三分局1922專線於十一月二十五日接獲馮太太反應，其女於十ㄧ月二十四日在校接種H1N1疫苗後出現暈眩、想吐、左半側麻痺，經觀察後未改善，送澄清醫院急診收住院，當日下午4時20分，該局立即派遣小兒專科之防疫醫師前往探視瞭解病情，經與其主治醫師討論表示初步神經學檢查均無異常，現場向馮母解釋並表達關懷，並請澄清醫院醫療團隊全力照顧；本局為求慎重亦於當日晚間召開專家（其中包含台大小兒科李秉穎教授、黃立民教授、神經科吳瑞美教授、馬偕醫院邱南昌主任、長庚兒童醫院林奏延院長等）電話會議，會議中專家初步排除疫苗之相關性。
該女童於澄清醫院多項檢查（MRI、MRA、電腦斷層攝影、肌電圖等），初步結果都正常；十一月二十八日轉診台中榮總神經科住院檢查，一系列檢查結果也正常，進行復健後逐漸恢復，十一月三十日防疫醫師再度前往台中榮民總醫院瞭解病情，並鼓勵該生積極配合醫療團隊治療，以期早日恢復健康，馮生於十二月四日傍晚出院。
期間馮母多次進線1922尋求協助，疾管局人員也多次主動與馮母聯繫，關心馮生病情狀況，耐心聽其陳述且向其說明預防接種受害救濟程序並給予精神安慰，並積極聯絡台中縣、市衛生局協助其申請預防接種受害救濟，台中縣衛生局陳局長及台中市衛生局林局長也曾前往關心並提供受害救濟申請表單，請家屬儘速提出申請；馮生家人已於十一月三十日提出申請，預防接種受害救濟委員會正安排進行審查，以確認其病徵與疫苗之相關性。
疾病管制局表示，馮太太數次電話聯絡該局，相關人員均立即提供心理支持及醫療諮商服務，並與臨床醫師保持聯繫關懷其恢復狀況；該局亦積極主動督導衛生局協助馮女士提出預防接種受害救濟，並無媒體所言之推諉情事。