衛生署本（5）日邀集傳染病防治醫療網6區指揮官、副指揮官假臺大國際會議中心召開「傳染病防治醫療網因應H1N1新型流感疫情回顧與展望會議」，就去（2009）年4月H1N1新型流感疫情爆發至今之相關防疫作為進行討論並提出因應第三波疫情之建言。會中楊署長志良頒獎表揚6區指揮官、副指揮官，感謝其於H1N1新型流感疫情期間之貢獻及付出。
傳染病防治醫療網應變醫院於本次新流感疫情初期即進入整備/應變狀態，包含負壓隔離病房自我查核、人力動員規劃、教育訓練/演練、病房戰備、防疫物資、運送動線等，並因應疫情需要即時啟動收治，提供病患妥適之醫療照護，另藉由防疫醫療體系之政策規劃、落實，及提升流感抗病毒藥物及快速篩檢之普及，使得台灣H1N1新型流感防疫成效，在與經濟合作與發展組織（OECD）會員國相比毫不遜色；我國新流感死亡率約每百萬人口1.8例，為OECD會員國平均死亡率(6.3)之三分之ㄧ，美國平均死亡率(8.3)之五分之ㄧ。
本次H1N1新型流感疫情，由於醫療體系之防疫規劃、整備發揮功效，且6區醫療網於轄區指揮官、副指揮官之領導下，發揮極佳之醫療及防疫功能，順利完成任務。目前國內第二波疫情已告一段落，防疫工作也將回歸常態運作機制，然為因應未來可能爆發之第三波疫情，衛生署將依據世界衛生組織之建議，檢討各項防疫政策及醫療體系因應作為，供未來防疫政策擬訂之參考。