針對報載民眾投書對於本年肉毒桿菌毒素中毒事件可疑食品之調查疑義，食品藥物管理局表示，食品與防疫之處理，各有專業，但在肉毒桿菌毒素食品中毒事件之處理，均係與疾病管制局共同合作完成，期在最短時間內找出中毒原因。因此，本次肉毒桿菌毒素食品中毒事件，在食品藥物管理局接獲疾病管制局通報後，立即責成苗栗縣衛生局及台中市衛生局進行食品中毒調查，並隨時與疾病管制局保持密切聯繫。
本次抽驗之可疑食品，係經兩局調查及研判，並對家屬以食品回憶法進行訪查，以及在學理上肉毒桿菌可能生長之條件下，研判可疑食品，始進行抽樣，而非投書者所言在患者家中胡亂採集及「採檢錯誤」之事。基於肉毒桿菌毒素食品中毒之風險較高，必須在第一時間要求可疑食品下架回收，並發布新聞提醒消費者注意。
由於肉毒桿菌毒素中毒事件不容輕忽，食品藥物管理局及疾病管制局持續共同合作，維護國人飲食之衛生安全，並積極追查可疑之病原食品。