為了提升對民眾口腔之醫療服務品質，衛生署經過2年之規劃，委託財團法人醫院評鑑暨醫療品質策進會邀集牙醫學專家學者，共同擬訂「二年期牙醫師畢業後一般醫學訓練計畫」，預定於99年7月1日正式推動實施，未來每位畢業之牙醫師，都要經過2年嚴謹臨床訓練，才可獨立開業。此舉乃係我國牙醫臨床訓練的大躍進，衛生署相信隨本計畫的實施，必能提昇全國牙醫醫療服務品質，嘉惠全體國人。
根據調查統計，每年約有350名之牙醫系畢業生。而依照醫療法第18條規定，醫師須有2年臨床實務訓練，始可擔任負責醫師，目前，牙醫系之學生畢業後大約有一半前往診所接受訓練，一半前往教學醫院訓練，然而，訓練內容及訓練機構之條件，並無明確規範，亦無審查機制，牙醫師於取得2年執業經驗之後，即可申請自行開業。衛生署有鑑於口腔醫療服務品質，攸關全體國人健康，且現今醫師訓練之要求，除了專業技術之外，更應強調醫學倫理、法規概念、以病人為中心的診療態度，以及全人照護的整體思維，因此，規劃了二年期牙醫師畢業後一般醫學訓練計畫，另為強化牙醫師對社區及公益的投入，遂要求於2年訓練期間，受訓之牙醫師均應前往學校、社區、偏遠地區及身心障礙者養護機構，提供口腔衛教、義診、口腔檢查與疾病篩檢等服務。
「二年期牙醫師畢業後一般醫學訓練計畫」訓練內容，分為68小時之基本課程，內含醫學倫理、醫事法律、感染控制與廢棄物處理、衛生政策、急救訓練、病人安全等等；另有18個月之必修核心課程，包括一般牙科全人治療訓練、社區牙醫學、口腔顎面外科及急症之處理訓練；以及6個月之選修課程，包含牙周病學、牙髓病學、補綴學、牙體復形學等9大專科。訓練過程特別強調牙醫師在治療牙齒時候，不能只有「看到」牙齒，而是要以「全人治療」角度，「看到」整個病人全部，站在民眾的角度，提供適切的服務。此項政策是我國牙醫師臨床訓練的一大躍進，目前衛生署按既定期程逐步推動計畫，並預定於99年7月1日正式實施。