98年8月8日莫拉克風災後，衛生署為提供災民心理重建服務，即補助南投縣、嘉義縣、台南縣、高雄縣、屏東縣、台東縣等6個衛生局，推動「莫拉克颱風後心理重建計畫」，以在地化服務作為原則，結合精神醫療、心理、護理、職能、社工等專業人員及公共衛生人力，深入災區、原民部落及各地之災民安置中心，提供受災民眾、罹難者之家屬心理衛生相關服務，以預防災民發生創傷後壓力症候群、精神疾病、自殺、藥物濫用等問題；截至目前為止，共計出動醫事人員4,737人次、關懷輔導災民22,499人次、提供精神醫療服務803人次、個別心理諮商559人次、團體輔導532人次、高危險個案之追蹤累計1988人、志工培訓643人次，以及教育訓練900人次。
除了補助災區之衛生局辦理心理重建計畫以外，另亦擴大透過醫療機構與民間之團體，共同參與災民心理重建工作，計有4家醫院（衛生署嘉南療養院、嘉義榮民醫院、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄市立凱旋醫院）、4所學校（台灣大學、台中護理專科學校、高雄師範大學、屏東科技大學）、3個民間團體（中華心理衛生協會、董氏基金會、花蓮縣臨床心理師公會）一起投入災民心理重建相關工作，而董氏基金會尤其積極熱心，他們在災害滿周年之時，特別製作一張名為「大雨終停，關懷與陪伴永不止」災難心理衛生宣導短片，強調災難帶來令人痛徹心扉的破壞與失落感，惟社會的關懷與陪伴，能協助災民們走出傷痛，迎向未來。
災難發生常不可測，應變能力要更增強，透過心理重建計畫，衛生署累積了一些經驗，希望藉由這些經驗精進災難心理衛生運作機制、編修災難心理衛生服務手冊、建立標準化之訓練課程、完成相關人員培訓，建置災難心理衛生之人才資料庫，以便災難發生之時，能夠迅速啟動應變機制，整合社區支持網絡，提供適當醫療服務、心理諮商，給災民們最大的協助與輔導。