衛生署食品藥物管理局及衛生局聯合分工檢驗體系負責動物用藥檢驗之實驗室共同合作，執行99年度市售食品殘留動物用藥監測計畫。10至11月份共抽驗30件畜產品（牛肉、豬肉及雞肉各10件），31件水產品（蟹類17件、甲魚5件、大閘蟹9件）。依類別檢驗，畜產品檢驗9項β-丙醯胺類抗生素，水產品檢驗氯黴素、孔雀綠、還原型孔雀綠及硝基?喃代謝物等藥物殘留。檢驗結果60件符合規定，1件甲魚檢出孔雀綠1.31 ppb及還原型孔雀綠2.07 ppb。
依衛生署「動物用藥殘留標準」，魚類不得檢出孔雀綠及還原型孔雀綠。不合格甲魚之檢驗結果立即傳真通知行政院農業委員會動植物防疫檢疫局及送驗衛生局，由地方衛生局聯合農業機關追查供應來源，已依食品衛生管理法對供貨業者裁處罰鍰新台幣三萬元，並由農業單位後續加強監測輔導。
食品藥物管理局將持續執行各類食品衛生安全之監測，同時秉持資訊公開原則，提供不合格食品資訊，作為民眾選購食品之參考，為確保飲食之安全與衛生，衛生署提醒消費者選購畜禽水產品時，最好選擇來源明確，認明有生產履歷或優良標章者。並呼籲飼養農戶應確實遵守動物用藥品管理法之規定，農業機關及衛生機關亦將會持續監測上市前及上市後畜禽水產品之動物用藥殘留。