有關二代健保何時實施問題，行政院陳院長於聽取衛生署所作之簡報後，獲致結論如下：
一、 實施時間
衛生署於101年6月底前將完成二代健保37項法規之修訂，但就保費收取，尤其是補充保費收取之執行面細節，仍須對民眾加強宣導與酌留扣費義務人扣款之規劃與作業時間，為能充分準備，行政院決定自102年1月1日實施二代健保。
二、 保險費率
二代健保實施後，費率之調整須由全民健康保險會（健保會）依照「收支連動、財務平衡」原則審議，經衛生署轉報行政院核定。目前依健保局之各種分析，如於102年1月開始實施二代健保，並採4.91%之費率，則可在105年以前維持健保之財務平衡(不含安全準備)。
健保局將以上開費率（4.91％）做為建議方案之一，提兩會聯席會討論，如有共識，衛生署將依照規定報行政院，行政院將依法予以核定。
三、 有關健保費補助款改由中央負擔部分
新修正健保法明文規定，原來各級政府應負擔之健保費補助款，將由中央統一負擔。為解決地方政府就健保費補助款之預算編列問題，行政院傾向將與健保補助款之負擔有關三個條文（27、28、35），提前實施，相關預算於101年下半年可由中央政府全額負擔。
四、 保費差額補助，持續至二代健保實施日為止
99年4月1日將費率由原來4.55％調為5.17％，對因費率調整而增加負擔之相對弱勢保險對象，由政府予以保費差額補助至二代健保實施日為止。配合二代健保將於102年1月1日實施，該補助措施將持續至今年年底。
另低收入戶之健保費，已由政府全額補助，中低收入戶之保費，於99年12月社會救助法修正後，已自100年7月開始，由政府補助其半數之保費，上述措施已兼顧弱勢民眾經濟負擔，因此未來配合費率調降取消保費差額補助，影響層面有限。
陳院長也要求衛生署應利用多出來的準備期間，做好詳細的規劃與充分的準備，包括遴選種子教官，全面展開溝通與宣導工作，讓民眾、企業界及扣費義務人，對補充保險費如何負擔？如何扣取？都能有所瞭解，以利新制上路。