為提昇檢疫效能並與國際接軌，疾病管制局參考其他先進國家之檢疫方式，對於國際航機之檢疫方式，自今(2008)年1月9日(含)起，改為異常通報處理，並輔以人員入境健康篩檢措施之施行，以有效防堵疫病入侵，為我國邊境檢疫作為開創新頁。
配合航機檢疫方式之改變，該局並於今年1月7日修正發布「港埠檢疫費用徵收辦法」，取消航機檢疫規費之徵收，惟該局提醒航空公司，當旅客或航員在飛航途中，具有下列一種(含)以上之症狀時，可能疑似感染傳染病，應立即通知機場檢疫單位，以即時採取必要之防檢疫措施，可能之症狀包括：出現明顯的不舒服、持續性的咳嗽、呼吸不順或困難、持續性的腹瀉、持續性的嘔吐、皮膚出疹、不正常的出血或意識不清楚等，以上症狀如再伴隨有發燒(≧38.0℃)時，則感染傳染病之可能性提高。
現行自國外飛抵台灣之航機，其檢疫方式係由航空公司逐架次填報「航空器進(出)口檢疫資料」，該局機場檢疫單位以書面審查方式辦理，惟鑒於航機快速之特性，此方式對於即時防止疫病移入並無效益，因此決定修正航機檢疫作為，以提昇檢疫效能。
疾病管制局並呼籲出國的民眾，出國期間不生飲、不生食並加強個人衛生，避免接觸動物；預防登革熱、瘧疾及屈公病等蟲媒傳染病，應穿著淺色長袖衣物塗抹防蚊液，以防範病媒蚊叮咬；途中有任何不適，應請領隊或導遊協助於當地就醫，切勿延誤病情；有症狀民眾返國入境時應主動向機場檢疫人員通報，並填寫「傳染病防制調查表」；如在返家後出現身體不適，亦請儘速就醫並清楚告知旅遊史及接觸史以供醫師診治參考。