針對聯合報於今日報導「藍委轉述：健保局改制 侯規林不隨」，其中敘及健保局改制為公務機關後，國庫雖然少付33億元年終獎金，但增加的退休、福利，國庫每年卻要多付104億元乙節，對此健保局說明如下：
按健保局96年度行政管理經費之決算數僅為62億6069萬9291元，此項費用又包括用人費、水電費、郵費、旅運費、印刷費、宣導費、退休資遣費、設備維護費、用品消耗費、清潔費、委託調查研究費、租金費、IC卡製作費及對職業工會、農漁會、鄉鎮市區公所代辦健保業務之補助費等。此外，財團法人保險事業發展中心就健保局調整為行政機關之各項人事成本精算，依精算結果，預估健保局改制為行政機關後，每年國庫可節省成本1億元，是以上開報導所呈現之數據，與事實有甚大出入，特此澄清說明。