有關行政院消費者保護委員會發布之「國內大型醫院退伍軍人菌檢測結果」，疾病管制局表示，該局一向相當重視退伍軍人病之防治，自1999年納入法定傳染病監測外，2001年更進一步藉由「台灣院內感染傳染病監視資訊系統」，進行多元化之監測防治，並訂定「退伍軍人菌控制作業建議指引」，供醫療衛生界參考。2001年起加強監測迄今，計有2例病例為院內感染。
退伍軍人菌普遍存在於各類水體環境中，相當容易自各種環境中發現退伍軍人菌。另退伍軍人菌為伺機性感染，目前世界衛生組織（WHO）或美國疾病管制中心對於環境檢出退伍軍人菌與院內感染風險之相關性，仍持保留態度，故其針對例行性環境檢驗，亦僅採用建議之態度，並無全面性強制推廣。
雖然世界衛生組織（WHO）或美國並無相關強制規定，惟自5月份行政院消費者保護委員會委託學校針對國內大型醫院退伍軍人菌進行檢測之結果出爐，並對衛生及環保單位做出建議後，該局已訂於本（2008）年6月24日召開「衛生署傳染病防治諮詢委員會『感染控制組』2008年第二次會議」，並將「預防退伍軍人菌院內感染」納入議題，邀集醫療、環境衛生等專家學者，針對感染風險與環境監測等主題進行深入評估，行政院消費者保護委員會亦在邀請之列，共同參與討論。