衛生署疾病管制局公布2008年台灣地區腸病毒重症病例疫情現況，截至6/3止，總計136例確定病例，疫情明顯高於去年同期(10例通報，1例確定且死亡)。確定病例中，發病日介於1/2-5/27，個案健康狀況截至6/3止，16例住院中(11例ICU、5例一般病房)、116例已出院、4例死亡。性別比為1.8:1 (87/49)，均為10歲以下幼童。病患居住縣市以高屏區為主(57例，約41.9%)，超過10例的縣市依序為，高雄縣26例、屏東縣19例、台南市16例、彰化縣15例、台南縣13例、高雄市12例。病毒分型則以EV71型133例最多(其中1例另檢出CB2)、1例NPEV、1例Echo 6、1例CB4。定點醫師監視系統顯示，社區腸病毒疫情亦呈上升趨勢，第22週(5/25-5/31)病例比率為12.14?，較前1週（9.02?）高，亦較去年同期（6.44?）高。
為因應目前嚴峻之腸病毒疫情及提供社會大眾透明之疫情訊息，以及早做好因應措施，疾管局應用2006年至2007年健保及定醫監視資料庫，進行本年第1-35週(1/1-8/30)腸病毒(手足口病及泡疹性咽峽炎)疫情規模，預測腸病毒疫情將於本年第25週(6/15-6/21)達高峰。腸病毒重症疫情則以1998年至今之確定重症資料進行推估，預測：(1)腸病毒重症疫情將於本年6月達高峰。(2)本年第1-35週，約有340例重症確定病例。上述推估疫情規模，若因社會各界及早進行因應保護措施，疫情將可能減輕。
臺灣地區每年腸病毒流行期約為4-10月，由於嬰幼童感染腸病毒後，可能導致廣泛性的中樞神經傷害等後遺症，甚至死亡。疾管局呼籲民眾注意個人衛生、勤洗手、維持居家環境的清潔與通風，尤其是家有準媽媽或新生兒、幼兒的民眾更要特別注意防範。臨床醫師於診治病童時，須提高警覺，詳細問診，當病童出現重症前兆病徵時，亦應妥善處置，必要時轉診，以掌握治療黃金時間。該局亦將持續加強腸病毒之監測與防治。有關傳染病相關問題，請撥打1922傳染病諮詢專線洽詢，或參閱該局網站：http://www.cdc.gov.tw。