近年來結核病的盛行率，在防疫人員努力及都治計畫的施行之下，確實有逐漸下降的趨勢，從2005年至今發生率已下降近15％，且盛行率已低於世界衛生組織所訂定結核病達到控制的標準，可以說防治成果豐碩。然而對於這樣的成績，疾病管制局郭旭崧局長於日前召開的「結核病工作小組98年度第1次會議」中表示：「疾病防治工作永遠沒有足夠的一天，由於去年新案發生率下降幅度趨緩為3.12％，98年度對於結核病防治工作，疾管局仍應改善不足的地方，並朝以下三大方向努力：擴大都治(DOTS)辦理對象、加強個案發現、提升實驗室檢驗量能，尤其是擴大分生診斷範圍。
台灣自從2006年執行十年減半計畫以來，發生率總降幅已達約15%，死亡率下降達19%，而依世界衛生組織結核病達到控制的標準（20歲以上人口盛行率0.143%）來比較，我國盛行率更已超越該項標準，可以說是成效豐碩。其中前五名的縣巿分別為新竹縣巿、南投縣、嘉義巿和花蓮縣。
但是郭局長日前主持「結核病工作小組98年度第1次會議」時，再次強調：我國擬訂「結核病十年減半計畫」雖然相較WHO防治結核病的標準嚴格很多，但無論如何這是疾管局對於國人的健康安全的承諾與責任。郭局長肯定所有工作同仁過去的辛勞，但去年發生率下降幅度趨緩為3.12％（前二年為7%和6%），是結核病防治工作應再加強努力的部份，這也是疾管局責無旁貸的任務。同時局長也於會中裁示2009年三大防治方向，期許工作同仁上緊發條，為結核病防治工作再創佳績，提供國人健康衛生的生活環境。