為因應墨西哥、美國及加拿大等地區爆發H1N1新型流感疫情，行政院「H1N1新型流感中央流行疫情指揮中心」強調目前國內無疫情，現階段防治重點將加強「監測通報」。
H1N1新型流感目前列為第一類法定傳染病，若醫療人員發現H1N1調查病例須於24小時內通報，同時採件送驗，並開立抗病毒藥劑處方予民眾。對於不需住院病情輕微的民眾，需配合進行居家隔離，以避免疫情散播；醫師診療評估後認為有住院必要者，將收治於負壓隔離病房予以治療。
衛生署疾病管制局並呼籲醫療機構中之醫療照護人員應依照院內感染控制指引，遵循飛沫及接觸防護措施，依需求配戴口罩、隔離衣、護目鏡、手套等，並注意手部清潔，以防止院內感染之發生。
由於國內尚未出現病例，民眾不必過度恐慌，相關國際疫情，防治措施及H1N1新型流感病例通報定義等資訊，可參閱疾病管制局全球資訊網，網址http://www.cdc.gov.tw，點選國際旅遊資訊或H1N1新型流感主題專區，也可撥打免付費民眾疫情通報及諮詢專線1922洽詢。