莫拉克颱風在台灣造成重創，衛生署為保障災民的醫療需求，已特別建置因應救災藥品措施，並重申救災藥品與醫療器材供應無虞。衛生署已設立受理藥品與醫療器材物資捐贈專線0800-625-748，請彙整有意捐贈者所能提供物品之項目與數量，並請其就地存放，待衛生署彙整物資調度之需求及相關資訊後，將立即通知其提供與調度。
一、依「藥品醫材儲備動員管制辦法」，衛生署平日已要求各縣市應備有戰備重要外傷用藥品與醫療器材之儲備，本次為因應莫拉克颱風所造成災害，衛生署已緊急啟動應變措施，相關藥品與醫療器材也自災情發生起，已開始調度使用，如果災區當地儲備量用罄時，馬上就近調度其他縣市之儲備藥品、醫療器材。
二、因災後許多企業與民眾皆想為災區盡一份心力，為避免救災藥品供應混亂，衛生署將彙整物資調度中心之需求及相關資訊，統一調度，以避免大量物資湧入災區影響災民實際物資需求的供應。
另外，衛生署於8月15日緊急召開因應莫拉克水災協調製藥公會捐贈藥品會議，台灣區製藥工業同業公會表示全力支持，結合所有國內藥廠會員之力量，共體時艱，提供藥品，全力支援賑災所需。