為加強對食品中真菌毒素之管制，衛生署已預告「食品中真菌毒素限量標準」草案，除現有之黃麴毒素限量規定，並增列食品中赭麴毒素A（Ochratoxin A）、棒麴毒素（Patulin）及橘黴素（Citrinin）等三項限量標準，預定98年9月25日評論期結束後，如無特別意見，即正式發布施行。該草案內容可自衛生署網站（網址：http://www.doh.gov.tw）或食品資訊網（http://food.doh.gov.tw）查閱。
部分黴菌在生長時天然產生對人類或動物有害的代謝物質，屬於真菌毒素，如果長期大量攝食，可能對人體健康有影響，例如肝臟受損，甚至具有致癌性。因此，目前國際間將食品中真菌毒素污染之問題列為食品安全管理重點之ㄧ。衛生署亦十分重視此一問題，除歷年來持續加強食品業者對食品原料之品管及貯存條件之管控外，更進一步檢討研修食品中真菌毒素之限量標準，以降低國人從食物中攝入真菌毒素之機會，維護國民健康。
食品在適當條件下可能孳生黴菌。例如花生、核果、玉米、米、麥、高粱、豆類、水果、麵包等食物提供了黴菌生長所需的營養，只要在適當的溫濕度環境中，黴菌便能生長，進而可能產生毒素。為確保飲食健康，國人於購買各類食品時應注意其外觀正常無異狀，並做好妥善保存，將食物儲存於乾燥陰涼的環境中，避免受潮，注意保存期限，如果發現長黴菌的食物，應即丟棄，避免食用後，影響身體健康，如此可將安全疑慮降到最低。
目前國際食品法典（Codex）已訂定黃麴毒素在花生、杏仁等堅果類及牛乳、赭麴毒素A在麥類及棒麴毒素在蘋果汁、含蘋果汁的混合飲料之限量標準；歐盟、美國及加拿大等先進國家亦對食品中真菌毒素定有相關標準；我國現行食品衛生管理法相關規定對食品中真菌毒素含量之管制，已就黃麴毒素訂定其在花生、玉米、米、高粱、豆類、麥類及堅果類、食用油脂類、鮮乳、乳粉、其他食品及嬰兒食品之限量標準。衛生署依據科學評估原則，參考國人飲食習性，彙整食品原料中真菌毒素含量相關之歷年研究調查資料，及參考國際食品法典規範，研訂食品中真菌毒素限量標準，新增赭麴毒素A於米、麥類食品、棒麴毒素於蘋果汁、含有蘋果汁的混合飲料及橘黴素於紅麴色素、原料用紅麴米及使用紅麴原料製成之食品之限量標準，並經提送該署食品衛生安全諮議委員會審查完竣，俟正式發布，將可對我國食品之衛生安全及社會大眾之飲食權益，提供更多保障。