指揮中心接獲反映，部分民眾在接受H1N1新流感疫苗後，發生發燒等流感症狀，經流感快速篩檢發現呈陽性反應，以為係施打疫苗所致。指揮中心特別澄清，國內所使用之新流感疫苗，不論係國產或進口疫苗均使用裂解後之死流感病毒所製造，也就是疫苗中僅含有流感病毒的少部分成分，藉此刺激人體產生抗體，不會造成受施打者因此感染流感的情形。施打流感疫苗後產生流感快篩陽性反應，最有可能是在施打前即已受流感病毒感染，施打時正處於潛伏期，而於施打後產生流感症狀；另一種可能為施打後未產生抗體前，即遭受流感病毒感染，因此產生流感症狀。絕非因施打流感疫苗而導致感染流感。

指揮中心指出，施打流感疫苗後，一般均需2至3週才能產生足夠抗體。因此施打疫苗後，仍應持續勤洗手、生病戴口罩速就醫、不上班不上學等防護措施，以保護自己及周遭家人朋友的健康。