指揮中心表示，疾管局經過兩週的沉潛與省思，多方徵詢各界專業意見後，決定打破沉默，以整體公眾利益為優先考量，採取「更主動」、「更明快」、「更透明」的方式因應H1N1疫苗接種不良事件。
具體而言，今後對於足以影響社會公益、懸而未決的疑似疫苗接種不良反應事件，將由疾管局主動提送預防接種受害救濟審議小組（VICP），鑑定疫苗受害原因，不再苦等當事人或其家屬提出申請。另全國各醫療院所須配合提供病歷資料，不得拒絕。
據此，疾管局將主動提送彰化縣17歲陳姓個案至本週四召開的VICP會議，及早釐清原因。該案將成為新政策之首例。
有關要求醫療院所配合乙節，指揮中心已依據傳染病防治法第五十三條：「中央流行疫情指揮中心成立期間，指揮官基於防疫之必要，得指示中央主管機關彈性調整第三十九條、第四十四條及第五十條之處置措施。」，發函各醫療院所。
疾管局表示，對於採取更主動及更明快的處置，而遭非議或損及個人利益，絕非所願，但基於最大公眾利益考量，必須突破現有體制的框架，進行改革。