為了貫徹「想打的民眾都打得到」的政策目標，方便民眾施打新流感疫苗，衛生署疾病管制局自2月1日起至2月13日(除夕)在松山、桃園、清泉崗、小港機場及台北車站設置疫苗接種站，截至2月11日止，接種站總共服務了1,130名民眾，而在疫苗廠牌的選擇，國內與國外廠牌比例相當，顯示民眾對於兩種廠牌疫苗都非常支持。
對於疾管局在機場及車站設站接種，雖有少數民眾質疑疫苗安全性、也有民眾抱怨打針怎麼沒有送牛排，但也發生了許多讓接種站工作同仁感到"足感心"的小故事，像是有學校老師率眾前往接種，接種後贈送工作人員麵包，給予鼓勵，還有家長特地攜帶家中國小孩童前來接種第二劑疫苗，並感謝政府設站提供服務，另外，也有一些在台旅遊的外籍人士，稱許我國此項便民服務，希望可以接種疫苗，但礙於疫苗僅限於提供國人以及有居留證的外籍人士，也只能跟這些外籍旅客說抱歉。
本次機場設站是委由署立台北醫院、壢新醫院、梧棲童綜合醫院、署立旗山醫院、臨海醫院以及高雄市立民生醫院協助辦理，而台北車站則是由疾病管制局動員全局防疫醫師、護理同仁及防疫人員輪番上陣服務民眾；該局趁著與民眾面對面接觸的機會，貼近民眾並分享這段期間以來推行疫苗接種政策、處理H1N1新流感不良事件個案經驗，藉由這樣直接的接觸，了解民意，化解民怨與疑慮接種疫苗，讓民眾都能過一個健康平安的快樂年。
指揮中心表示，感謝四個國際機場與台北車站及醫院等單位的鼎力協助，讓接種站設置圓滿成功。