「全民健康保險醫療品質資訊公開網」99年新增「透析治療(洗腎)」、「消化性潰瘍」、「氣喘」等三類疾病別醫療品質指標供參考，提供血液透析效率(Kt/V)檢查比率、血液透析血清白蛋白(Albumin)檢查比率…等指標，作為病患就醫前評量醫療院所對透析治療的照護品質參考，提供氣喘病人加入照護計畫比率、氣喘病人出院後14天內再入院比率…等指標，作為病患就醫前評量醫療院所對氣喘病的照護品質參考，提供消化性潰瘍病患接受除菌藥物治療比率、消化性潰瘍病患開始治療1年內有用口服抗發炎劑比率等指標，作為病患就醫前評量醫療院所對消化性潰瘍的照護品質參考。
該網站提供更新的蒐尋方式，當在「院所查詢」點選「地圖式蒐尋」時，會呈現各項照護品質指標的整體結果，包括：趨勢圖、分區比較圖、醫療院所層級別比較圖等，另當滑鼠移至台灣地圖縣巿位置時，將呈現該縣巿的數值。民眾亦可透過台灣地圖，點選所在位置縣市鄉鎮區別之醫療院所，當選取多個院所資料後，可直接呈現院所比較圖，更加方便民眾就醫參考，另點選「醫療機構名稱」後，可呈現該院所相關資訊，例如：院所地理位置圖、地址、電話、科別、預防保健業務等資訊，更加便民。
中央健康保險局全球資訊網下的「總額協商醫療品質資訊公開」亦提供相同的蒐尋及操作方式，該網站自94年起迄今共揭露了73項院所別醫療品質資訊，並有諸多訊息可供就醫參考，民眾可直接上中央健康保險局全球資訊網站(www.nhi.gov.tw)，點選「醫療品質資訊公開」專區，就有「全民健康保險醫療品質資訊公開網」及「總額協商醫療品質資訊公開」二大院所別醫療品質資訊供查詢。