衛生署楊署長即將於五月份率團前往日內瓦，參加今年度的世界衛生大會，由於H1N1流感大流行的防治成效勢必將是討論焦點，因此，中央流行疫情指揮中心成立期間的總指揮官--行政院朱副院長特於今(4/21)日，召開H1N1防疫總結記者會，就我國的H1N1防疫歷程進行整體回顧及檢討，從衛生署提出的客觀數據證明，我國的防治成效不論是H1N1流感死亡率或是全人口疫苗施打，均不亞於歐美先進國家。因此特別指示楊署長，應藉此機會及國際場合，將台灣防疫經驗及成果展現出來。
我國H1N1的防疫歷程可分為「圍堵」、「減災」及「疫苗接種」等三個階段，朱副院長特別說明各階段的防治措施，有效減輕了國人初期對疫情的恐慌，以及縮短病人診治時程、改善醫院急診擁塞狀況，並延緩疫情高峰，最後因25%國人接種疫苗，使疫情趨勢急速下降，第二波疫情得以在農曆春節過後確定結束。由於我國的H1N1流感防治成果在國際上名列前矛，顯示我們的國民素質、醫療水準及政府效能均不亞於先進國家，甚至更為優秀，是所有國人的驕傲，朱副院長特別請楊署長，務必透過世界衛生大會等各種可能的國際場合，展現出這些成果，同時也要檢討及改善相關防治工作之不足處，以使我國的防疫機制更為完善。
衛生署更提出客觀數據證明我國的防治成效，包括：我國的H1N1流感死亡率為OECD會員國平均值的三分之一，為美國的五分之一，與所有OECD國家相比較，排行是第三低；全人口疫苗施打的比率為全球第五，而醫事及防疫人員、國小及國中學生的施打比率分別為全球第一及第二位；在疫苗安
全部分，接種後不良反應的發生數低於背景值，所通報46件接種後死亡病例，有39件已完成審議或鑑定，沒有一位案例的死因與疫苗有關，顯示疫苗安全沒有問題。
楊署長則指出，這次我國的H1N1防疫能有以上成果，相關部會全力配合中央流行疫情中心的運作，亦功不可沒；而全民健保制度，更是為病患醫療服務的提供，奠定完善的基礎；此外，台灣自去年開始加入國際衛生條例運作及參與世界衛生大會，則使防治工作有效與國際接軌。張副署長及疾病管制局郭局長另表示，雖然中央流行疫情指揮中心已解散，但防治工作並未結束，衛生署還是在持續進行疫情監視，同時將設法改善疫苗安全制度，重建民眾對疫苗安全的信心。