台灣衛生署疾病管制局於H1N1新流感大流行期間，針對「325停課措施」、「流感併發重症預後」與「孕婦疫苗接種」進行之3篇相關研究，均獲得國際新興傳染病研討會（International Conference on Emerging Infectious Diseases, ICEID）接受為口頭報告。該研討會由世界衛生組織、美國疾病管制局等衛生相關組織自1998年起共同舉辦，旨在藉由專題報告或海報展示等方式，建立世界各國公衛相關領域之專家學者有關新興傳染病之學術研究與公衛現況交流平台。
第1篇報告分析自2009年8月起，台灣在全國各級學校實際執行「325停課措施」期間，每日停課班級比例與流感就診人次之關聯性。結果顯示早期採行停課措施可有效延緩疫情高峰。
第2篇則利用截至2009年10月底法定傳染病通報系統資料，配合病歷回顧，比較共654位新型流感住院病患與季節性流感住院病患臨床表現與預後。分析發現感染不同型別病毒雖與死亡率無明顯關聯，但潛在疾病、年齡在65歲以上、住院時淋巴球低下、發病至抗病毒藥物使用間隔大於48小時之病患預後較差。
第3篇報告則評估截至2009年12月31日止，孕婦感染新流感併發重症與接種後發生妊娠相關不良事件風險。結果顯示孕婦感染新流感併發重症之風險為未懷孕之育齡婦女之2.7倍，而追蹤已接種新流感疫苗之14,328位孕婦中，自然流產、死胎、新生兒死亡之不良事件通報率均未高於未接種者之背景值。
客觀數據陸續證明我國此次H1N1防治成效不亞於歐美先進國家，衛生署未來也將持續透過學術論文發表與國際學術研討會場合，將台灣防疫經驗與全球分享。